用字母代替数字分析限制酶对DNA切后的结果
来源:绥宁一中校园网 作者:杨昌达 更新时间:2012-5-25 阅读:34395次 

用字母代替数字分析限制酶对DNA切后的结果

确定酶切点及图谱

湖南省绥宁县第一中学 葛芝谷

例1           为了解基因结构,通常选取一特定长度的线性DNA分子,先用一种限制酶切割,通过电泳技术将单酶水解片段分离,计算相对大小,然后再用另一种限制酶对单酶水解片

段进行降解,分析片断大小,下表是某小组进行的相关实验。

已知一线性DNA序列共有5000bp(bp为碱基对)

第一步水解

产物

单位(bp)

第二水解

产物

单位(bp)

A酶切割

2100

将第一步水解产物分离后,分别用B酶切割。

1900 200

1400

800 600

1000

100

500

500

B酶切割

2500

将第一步水解产物分离后分别用A酶切割。

1900  600

1300

800  500

1200

1000  200

经A酶和B酶同时切割

1900 1000 800 600 500 200

根据表中数据,请用图示标出酶切位点,并标明相关片断的大小。

解析:限制酶有专一性,且经A酶和B酶同时切割有6段。

为了方便设1900=x     200=y    800=m    600=n   1000=p

500=q,则根据先A酶后B酶,先B酶后A酶的结果则有:

x+y=2100①     x+n=2500②       m+n=1400③

m+q=500④        p+y=1200⑤

根据①②则有x y n的排列可能序列是:

⑥  n   x   y

y   x   n

同理,根据③④则有m n q的可能序列是:

⑦  n   m  q

q  m   n

则根据⑥和⑦及⑤则有排序:

q  m  n  x  y  p

那么片段的顺序及酶的切割点应是

A酶     A酶     A酶 

500  800  600  1900  200  1000

                 

      B酶      B酶

例2 现有一长度为3000个碱基对(bp)的线性DNA分子,用限制酶切后,进行凝胶电脉,使降解产物分开,用H酶单独酶切,结果如图I,用酶B单独切,结果如图2,用酶和酶B同时酶切结果如图3,请用图标出该DNA分子的结构及酶切图谱。

解析:用H酶和B酶同时切,有600bp、400bp、1400bp,根据题意只有三段是不行的,必须有四段,故可能有两段是重复的,则只有600bp片段有两段,且B酶切割只能在H酶切割的两则:

设x=400bp     y=600 bp   p=1400bp

则片段的排列可能有:

                   

                  

                                                     

 

则按顺序排列有:       

        x+y=1000bp          x+y=1000bp

         ①   y+p=2000bp    ③  p+y=2000bp

 y+x=1000bp         y+x=1000bp

          ②  y+p=2000bp    ④  p+y=2000bp

通过分析只有③的排列合符题意。

即DNA分子的结构及其酶切图谱是:

                       

400    600   1400   600

总结:通过用字母代替数字再根据题意进行分析,感觉就不抽象,思路就清晰具体。

 (此文在2011年参评湖南省教育协会论文大赛获叁等奖)

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